Neste artigo você aprenderá emitir um CT-e no Clipp Store em todas as suas variações (tipo de documento e tipo de serviço prestado), iremos explicar de forma clara e objetiva a emissão de cada variação, que são essas listadas abaixo:
Caso queira emitir o CT-e OS (Transporte de Pessoas, Valores ou Excesso de Bagagem), Cliqui Aqui
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Para emitir um novo CT-e Normal com Tipo de Serviço Normal, abra o Emissor e em seguida clique no botão Novo 
Informe a Natureza de Operação juntamente com os dados de Remetente e Destinatário.

Caso não apresente a natureza de operação que necessita, cadastre clicando no botão 
Os campos de Expedidor e Recebedor só deverão ser preenchidos caso o Tomador do Frete for indicado como Expedidor e Recebedor.
Caso um CT-e internacional for emitido, ou seja, para fora do país, as configurações do cadastro do cliente precisam ser feitas no seguinte formato.

OBS: Os dados acima são um EXEMPLO, para a emissão do seu documento, consulte os dados corretos com a contabilidade.
Iremos fragmentar a guia para explicar cada assunto de forma mais sucinta:
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Frete

Composição do Frete
Logo abaixo, no campo de Componente poderá escolher algum já listado, ou digitar algum outro que deseja, aqui iremos inserir os valores do CT-e.

Selecione o componente e clique no botão
para copiar a ação e o valor para o quadro ao lado.
Ao lado, no quadro Tomador do Frete deverá indicar quem irá pagar pelo Frete:

Caso marque a opção Consumidor final não contribuinte habilitará o campo de ICMS Partilha Interestadual
ATENÇÃO: Caso indique o Tomador do Frete como EXPEDIDOR ou RECEBEDOR é obrigatório Informar cada um em seu respectivo campo, clique aqui
Impostos
No rodapé do CT-e conterá as informações de Impostos.

Caso tenha dúvidas no preenchimento deste campo, consulte sua contabilidade.
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Clicando na guia CT-e Normal será possível incluir as Unidades de medida dos itens que irão ser transportados, além da quantidade e das informações da carga:

Após preencher os dados, clique no botão
para incluir no quadro ao lado, faça isso com todos as unidades de medida dos itens transportados.
Informações da Carga
Neste campo é necessário preencher o Valor da Carga, Valor da Carga para Averbação (valor que o seguro irá cobrir) e também o Produto Predominante (Item que mais está presente na carga Ex: Refrigerante)
Clicando na guia Notas Fiscais poderá vincular os documentos fiscais dos produtos transportados, poderá incluir vários documentos neste campo.
Para vincular a(s) nota(s), clique na aba Notas Fiscais e clique no botão .jpg)

É possível escolher entre NF-e, NF modelo 1/1A ou Produtor Rural ou outros Documentos / NFC-e.

No campo de dados adicionais basta adicionar, caso queira, os Dados Adicionais, sendo eles: Observações e Informações Adicionais ao Fisco

Feito isso, poderá Finalizar o CT-e e será necessário emitir o MDF-e dele, para saber como emitir clique aqui.
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Além do CT-e normal, é possível emitir um CT-e complementar, essa opção só pode ser emitida pela empresa quando há o objetivo de aumentar o valor do serviço (frete) inicial ou complementar o valor do ICMS. Isso significa que nenhuma outra informação pode ser alterada, somente os valores descritos e a data. Esse tipo de CT-e não pode ser usado para acrescentar dados a um documento cancelado ou anulado.
Para emitir o CT-e complementar é necessário informar no cabeçalho do CT-e que o mesmo é de complemento.

Após clicar na opção, no rodapé da nota já ficará habilitado o campo para vincular a chave do documento a ser complementado.

Feito isso, poderá Finalizar o CT-e e será necessário emitir o MDF-e dele, para saber como emitir clique aqui.
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Essa modalidade é utilizada para as situações em que o emissor não pode cancelar ou enviar uma carta de correção. Esse documento permite que o valor pago em tributações seja restituído na apuração. Vale ressaltar que o prazo para a emissão desse documento é de até 60 dias após o lançamento do primeiro.
Para emitir o CT-e de anulação é necessário informar no cabeçalho do CT-e que o mesmo é de anulação.

Após clicar na opção, no rodapé da nota já ficará habilitado o campo para vincular a chave do documento a ser anulado ou substituído juntamente com a Data de Emissão da Declaração.

Feito isso, poderá Finalizar o CT-e e será necessário emitir o MDF-e dele, para saber como emitir clique aqui.
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Este procedimento é utilizado para corrigir valores, pois a SEFAZ não permite que o tomador do serviço (pagador do frete) seja alterado com CT-e de substituição. O prazo para emissão deste documento é de 90 dias, contados a partir da data de emissão do CT-e que será substituído.
Para emitir o CT-e substituto é necessário informar no cabeçalho do CT-e que o mesmo é de substituição.

Como o CT-e é de substituição, deverá informar os dados que substituirão o CT-e anterior.
É necessário preencher o Valor da Carga, Valor da Carga para Averbação (valor que o seguro irá cobrir) e também o Produto Predominante (Item que mais está presente na carga Ex: Refrigerante).
Na aba de CT-e Substituição deverá lançar a chave do CT-e original a ser substituido ou a Chave de acesso do CT-e de anulação (caso tenha emitido).
Clicando no botão
poderá vincular as chaves das modalidades:

Feito isso, poderá Finalizar o CT-e e será necessário emitir o MDF-e dele, para saber como emitir clique aqui.
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Existe a possibilidade de escolher diversos tipos de serviços, dentre eles:
No cabeçalho do CT-e deverá marcar a opção desejada

Após marcar, no rodapé serão disponiblizados os campos para preenchimento dos dados:

É necessário preencher o Valor da Carga, Valor da Carga para Averbação (valor que o seguro irá cobrir) e também o Produto Predominante (Item que mais está presente na carga Ex: Refrigerante).
Além disso, será disponbilizada a aba Documento de Transporte Anterior.

Clicando na opção abrirá a tela para preenchimento dos dados:

Após preencher, clique em Concluir e finalize o CT-e.
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Utilizado quando o serviço de transportes é feito por mais de um modo (rodoviário, aquaviário, ferroviário, aéreo e dutoviário).
No tipo de serviço, escolha Serviço Vinculado a Multimodal

Após marcar, no rodapé serão disponiblizados os campos para preenchimento dos dados:

É necessário preencher o Valor da Carga, Valor da Carga para Averbação (valor que o seguro irá cobrir) e também o Produto Predominante (Item que mais está presente na carga Ex: Refrigerante).
Após escolher as opções, poderá Finalizar o CT-e.
Clicando com o botão direito no CT-e serão apresentadas as seguintes opções:

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